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生物實驗介紹蛋白修飾位點分析實驗原理
更新時間:2022-12-08   點擊次數(shù):767次

蛋白修飾位點分析實驗原理


先通過IP得到目的蛋白,再通過SDS-PAGE對目的蛋白進行分離純化,將膠條上目的蛋白對應(yīng)的條帶切下進行膠內(nèi)酶解和高靈敏度的液質(zhì)聯(lián)用分析(LC-MS/MS),通過數(shù)據(jù)庫檢索得到蛋白上的修飾位點。

蛋白分析的應(yīng)用

1. 磷酸化:信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、細胞周期、生長發(fā)育及癌癥機理等;

2.糖基化:蛋白質(zhì)折疊、更新以及免疫應(yīng)答等;

3.乙酰化:基因表達調(diào)控、細胞凋亡、細胞代謝、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性以及神經(jīng)退行性病變等;

4.泛素化:細胞周期、細胞凋亡、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA修復(fù)以及信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等;

5.甲基化:染色質(zhì)結(jié)構(gòu)及轉(zhuǎn)錄調(diào)控等;

6.丙?;?/ 丙二酰化 / 戊二?;?/ 琥珀酰化:主要存在于線粒體和細菌中,與代謝過程密切相關(guān)。

實驗流程

1.IP溶液/膠條;

2.蛋白酶消化;

3.LC-MS/MS分析;

4.搜庫后分析,蛋白鑒定、翻譯后修飾分析。

實驗完成周期及交付標(biāo)準(zhǔn)

1. 周期:6周左右

2. 交付標(biāo)準(zhǔn):質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)、白鑒定列表、肽段信息表、實驗報告(主要儀器、試劑和實驗方法)

需確認(rèn)的信息

1. 樣品:如果樣品為蛋白質(zhì)溶液,蛋白質(zhì)總量≥300mg; 如果是組織樣品,樣品總量≥0.1g; 如果是細胞樣品,細胞數(shù)量≥107個;如果是體液樣品,血清≥200ml,腦脊液≥200ml,尿液≥1ml,淚液≥1ml;

2. 樣品采集過程中使用到塑料制品時,盡量使用無色進口產(chǎn)品,以減少塑料制品中雜質(zhì)對質(zhì)譜檢測的影響;

3. 確認(rèn)樣品所屬種屬、分析需求。



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